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Ante cualquiera de los dos escenarios, el SGI no realizará de forma automática ninguna acción sino que mostrará avisos para que sea el personal de gestión quien adapte, si fuera necesario, la configuración de los periodos de justificación del proyecto.
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Si una vez credo el proyecto se añade un nuevo periodo de justificación a la convocatoria, se mostrará un aviso informativo en el proyecto para que el personal de gestión decida si se añade el periodo también al proyecto. Siguiendo con el ejemplo, se añade a la convocatoria un periodo de justificación, modificando previamente el tipo del que previamente era el periodo "final", que pasa a ser periódico.
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9.2.3 Modificar periodo de justificación en la convocatoria
Los periodos de justificación podrán ser modificados a nivel de convocatoria una vez que ya existan proyectos asociados a la misma y, por tanto, sobre los que se hubiera volcado la configuración de periodos de justificación que tuviera la convocatoria en un primer momento. Cuando esto sucede, la modificación realizada en el periodo de la convocatoria no se traslada de manera automática a los proyectos (para evitar machacar algún cambio que ya se hubiera podido realizar en los periodos de justificación del proyecto a nivel particular). En lugar de esto, se mostrará un icono de aviso 
en el listado del calendario de justificación del proyecto, resaltando que sus datos difieren respecto a los de la convocatoria de procedencia.
Siguiendo con el ejemplo incluido en el apartado Añadir periodo de justificación en la convocatoria, en el que se añadía un nuevo periodo en la convocatoria y se modificaba el tipo de uno de los existentes:
Se mostrarán dos avisos en el proyecto, el que refleja la existencia de un nuevo periodo en la convocatoria, 
, detallado en el apartado Añadir periodo de justificación en la convocatoria y el aviso que identifica que el periodo presenta cambios respecto a la configuración de la convocatoria.
Al pasar el ratón por encima del icono de aviso se mostrará un mensaje informativo
Al pulsar el botón Editar del periodo se podrán ver los cambios introducidos en la convocatoria respecto a la configuración inicial del proyecto. En la parte derecha se mostrarán los nuevos datos del periodo en la convocatoria y en la izquierda los datos del periodo en el proyecto.
Si se desea aplicar los cambios de la convocatoria al proyecto se debe pulsar el botón "Aplicar al proyecto". Los datos del periodo en el proyecto se machacarán con los datos del periodo en la convocatoria.
Tras pulsar el botón "Aceptar", el periodo pasará a tomar los mismos datos que en la convocatoria dejando pues de visualizarse con el icono de aviso
9.2.4 Añadir periodo de justificación en el proyecto
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